ТАСС, 24 февраля. Молекулярные биологи выяснили, что Т-клетки 90% вакцинированных москвичей эффективно распознают и нейтрализуют частицы омикрон-варианта SARS-CoV-2. Об этом пишет пресс-служба НИУ ВШЭ со ссылкой на статью*, опубликованную в bioRxiv.
"Мы показали, что от одного из вариантов главного комплекса гистосовместимости (HLA) вирусу удалось частично скрыться. Это означает, что вакцинированные люди с вариантом HLA-DRB1*03:01, а в Москве таких около 10%, могут тяжелее переносить болезнь, вызванную штаммом омикрон", – рассказал один из авторов работы, декан факультета биологии и биотехнологии ВШЭ Александр Тоневицкий.
Появление омикрон-варианта коронавируса нового типа усилило опасения ученых относительного того, что в ближайшее время могут появиться новые вариации вируса, стойкие к действию вакцин и антител. Российские ученые заинтересовались, как изменения в структуре генома вируса будут влиять на характер его взаимодействия с другим ключевым компонентом иммунитета – так называемым главным комплексом гистосовместимости.
Так ученые называют особый набор генов в шестой хромосоме человека, которые управляют производством набора белков, играющих ключевую роль в приобретении иммунитета к SARS-CoV-2 и другим вирусам. Они отвечают за транспортировку фрагментов белков этих патогенов на поверхность клетки и их последующую передачу в Т-клетки, что помогает им распознавать зараженные тельца и впоследствии уничтожать их.
Защита от омикрона
Как объясняют Тоневицкий и его коллеги, в геноме каждого человека есть несколько десятков вариаций генов из семейства HLA, чья комбинация определяет, насколько он уязвим к разного рода инфекциям. Российские ученые исследовали, как различия в устройстве всех распространенных подтипов этих генов влияли на характер взаимодействий иммунитета со штаммом "омикрон".
Для этого исследователи использовали разработанный ими алгоритм T-CoV, позволяющий быстро просчитать, как будут взаимодействовать Т-клетки человека с белками оболочки коронавируса. Для этих расчетов ученые использовали данные по разнообразию белков HLA, характерных для жителей Москвы, а также данные по структуре белков штамма "омикрон".
Как оказалось, этому штамму не удалось скрыться ни от одного варианта молекул HLA. При этом ученые обнаружили сразу несколько разновидносей главного комплекса гистосовместимости, чьи белки начали хуже распознавать и соединяться с белками оболочки варианта омикрон по сравнению с прошлыми штаммами SARS-CoV-2.
Сильнее всего эти перемены затронули носителей варианта HLA-DRB1*03:01. Их Т-клетки потеряли способность прочно связываться с S-белком коронавируса. Поэтому ученые предполагают, что люди с этой формой главного комплекса гистосовместимости будут тяжелее переносить инфекцию, что необходимо учитывать при их диагностике и лечении COVID-19.
Следует добавить, что статья, о которой рассказывается в этой новости, представляет собой так называемый препринт. Это означает, что ее не рецензировали независимые эксперты и не проверяли редакторы научных журналов, как это обычно бывает в подобных случаях. Поэтому к выводам из нее и аналогичных статей нужно относиться осторожно.