МОСКВА, 31 июля. /ТАСС/. Исследователи из России обнаружили свидетельства того, что популярная методика изучения работы генов, основанная на базе молекул микро-РНК, может выдавать непредсказуемые результаты из-за некорректной работы фермента, отвечающего за формирование этих коротких цепочек нуклеотидов. Об этом сообщила пресс-служба НИУ ВШЭ.
"Как показала наша работа, увидеть смещение положения разрезания исходной молекулы РНК на нити микро-РНК позволяет только секвенирование. К сожалению, это достаточно дорогостоящий метод, и не все лаборатории могут его себе позволить. Поэтому важно развивать современные методы сверхэкспрессии микроРНК и тщательно продумывать дизайн эксперимента", - пояснила заведующая международной лабораторией микрофизиологических систем НИУ ВШЭ (Москва) Диана Мальцева, чьи слова приводит пресс-служба вуза.
Ученые под руководством декана факультета биологии и биотехнологии НИУ ВШЭ Александра Тоневицкого уже много лет изучают то, как человеческие и животные клетки взаимодействуют с молекулами микро-РНК. Эти цепочки длиной в 20-25 генетических "букв"- нуклеотидов играют важную роль в регуляции активности большого числа генов в организме людей, так как они способны связываться с их РНК-копиями и препятствовать их чтению клеточными системами.
Сейчас ученые активно изучают возможность использования микро-РНК для борьбы с опухолями и лечения различных наследственных заболеваний, при развитии которых нарушается работа определенных генов, а также используют эти короткие цепочки нуклеотидов для изучения функций отдельных участков ДНК в живых клетках. В рамках этих опытов биологи вводят в клетки специальные длинные молекулы РНК, которые разрезаются на множество цепочек микро-РНК ферментом Dicer и затем блокируют работу генов.
Российские исследователи обнаружили в ходе опытов с молекулами-предшественниками микро-РНК, что белок Dicer далеко не всегда разрезает их так, как нужно биологам. Это связано с тем, что данный фермент действует по принципу "молекулярной линейки" при разрезании исходной молекулы РНК и отмеряет всегда одну и ту же длину - 22 нуклеотида. Данная особенность белка, как выяснили биологи, приводит к неправильному разрезанию длинной нити РНК в тех случаях, когда длина исследуемых микро-РНК превышает 19 нуклеотидов.
В частности, ученые обнаружили, что введение в клетки длинных молекул РНК, содержащих в себе множество копий микро-РНК вида miR-93-5p, чья длина составляет 23 нуклеотида, приводит к неожиданному подавлению активности гена HMGA1, чья работа не регулируется данной короткой цепочкой нуклеотидов. Это говорит о необходимости разработки инструментов, позволяющих выявлять подобные сбои в работе фермента Dicer при изучении функций генов и разработке методов терапевтического применения микро-РНК, подытожили ученые.
