Ученые из Петербурга исследуют пептид, обладающий потенциалом для лечения коронавируса
Сначала они изучат связывание пептида с белком-"шипом" методом ядерного магнитного резонанса, также будет использоваться компьютерное моделирование
САНКТ-ПЕТЕРБУРГ, 20 апреля. /ТАСС/. Международный коллектив ученых, включая исследователей из Санкт-Петербургского университета (СПбГУ), проверит способность пептида, расположенного на поверхности человеческой клетки, который недавно выделили ученые США, блокировать распространение коронавируса. Об этом говорится в сообщении, распространенном пресс-службой вуза в понедельник.
Как отметили в пресс-службе, в конце марта китайские ученые опубликовали кристаллическую структуру белка под названием ACE2 с поверхности клетки человека, с которым связывается белок-"шип" коронавируса, чтобы проникнуть в клетку. Это позволило исследователям из Массачусетского технологического института (США) идентифицировать и выделить фрагмент ACE2, с которым непосредственно связывается "шип". Это пептид из 23 аминокислотных остатков (IEEQAKTFLDKFNHEAEDLFYQS). По замыслу создателей пептида, он должен блокировать сайт связывания белка-"шипа", тем самым лишая вирус возможности "стыковаться" с ACE2 и проникать в клетки человеческого организма. В соответствии с такой интерпретацией авторы назвали свой пептид spike-binding peptide 1 (SBP1).
"Идея создать такой пептид могла появиться только после публикации структуры комплекса ACE2 с белком-"шипом" коронавируса, потому что только видя структуру комплекса двух белков, можно идентифицировать в составе одного белка небольшой фрагмент, который мог бы связываться со вторым белком", - процитировали в пресс-службе сотрудника кафедры биохимии СПбГУ и лаборатории биомолекулярного ЯМР Института трансляционной биомедицины СПбГУ Ольгу Рогачеву.
По информации пресс-службы, сначала ученые изучат связывание пептида с белком-"шипом" методом ядерного магнитного резонанса, также будет использоваться компьютерное моделирование. Главная цель экспериментов - доказать, что пептид связывается с нужным сайтом на поверхности белка и что это связывание достаточно сильное.
Если блокирующие свойства SBP1 подтвердятся, а также удастся доказать отсутствие неспецифического связывания пептида с другими белками, потенциально он может быть использован для создания лекарства от коронавируса, отметили в пресс-службе. Причем, как утверждают ученые, даже возможные мутации вируса не должны стать помехой для дальнейшей работы.
"Блокировать вирусные белки - не самая популярная стратегия, потому что вирусы постоянно мутируют, и в какой-то момент созданная молекула может перестать связываться с вирусным белком. Но SBP1 вырезан из ACE2 человека, поэтому если из-за каких-то мутаций белок-"шип" перестанет связываться с SBP1, то такой "шип" лишится и способности эффективно связываться с ACE2 и данный штамм SARS-CoV-2 уже не будет опасным для людей. С другой стороны, если когда-то появится новый коронавирус, использующий ACE2 для входа в клетку, то SBP1 будет применим и против него", - процитировали в пресс-службе вуза Ольгу Рогачеву.